MİDE KANSERİ VE E-KADERİN (CDH1) GENİ POLİMORFİZMLERİ ARASINDAKİ İLİŞKİ


Tezin Türü: Tıpta Uzmanlık

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Cerrahi Tıp Bilimleri Bölümü, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2021

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: Fırat Aslan

Asıl Danışman (Eş Danışmanlı Tezler İçin): Necat Almalı

Eş Danışman: Zehra Kaya

Özet:

Mide kanseri tüm dünyada yaygın görülen bir kanser olmakla beraber ülkemizde en sık görülen 6. kanser türüdür ve Türkiye’nin özellikle Doğu Anadolu bölgesinde sık görülmektedir. CDH1 geni hemen hemen tüm epitel dokularda ifade olan bir adezyon protein olan E-kaderin glikoproteinini kodlar. CDH1 polimorfizmleri ile mide kanseri arasındaki ilişki üzerine literatürde Türkiye dışında diğer bazı toplumlarda araştırmalar yapılmıştır. Bu çalışmanın amacı, Türkiye’nin Doğu Anadolu Bölgesinde mide kanserli hastalar ve sağlıklı kontroller arasında CDH1 polimorfizmlerinin (rs16260, rs13689, rs9929218) allel/genotip frekanslarını belirlemek ve mide kanseri yatkınlığı ile ilişkisini araştırmaktır. Literatürde rs13689 ve rs9929218 için mide kanserinde çalışmaya rastlanılmamış olup, rs16260 için ise mide kanserinde Türkiye’de hiç çalışma yapılmamıştır. Bu çalışma 2019-2021 yılları arasında 105 hasta ve 105 sağlıklı kontrol grubu üzerinde gerçekleştirilmiştir. Polimorfizmlerin genotiplemesi gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonunun (qPZR) kullanılarak TaqMan Assay yöntemiyle yapılmış ve sonuçlar istatistiksel analizler yapılarak belirlenmiştir. Mide kanseri riski sigara, vücut kitle indeksi (VKİ), aile öyküsü, biomasss maruziyeti, çay tüketimi, otlu peynir tüketimi ve reflü öyküsü gibi demografik faktörler ile anlamlı olarak ilişkili bulundu (p<0.05). Ayrıca SNP’lerden sadece rs13689 için hem T alleli (OR=4,03) hem de TT genotipi varlığında mide kanseri riskinin arttığı tespit edilmiştir (p<0,0001). Çalıştığımız diğer iki SNP (rs16260 CC genotipi ve rs9929218 GG genotipi) için ise hastalarda sigara içilmesi durumunda bu genotiplere sahip kişilerde hastalığa yatkınlık riskinin olabileceği görülmüştür (sırasıyla p=0,038, p=0,02). Mide kanserinde rs13689 ve rs9929218 Dünya’da ilk defa, rs16260 ise Türkiye’de ilk defa bu çalışma ile literatüre kazandırılmış olup, sonuçların doğruluğu için daha fazla çalışmaya ihtiyaç duyulmaktadır.