Adıyaman İli Tütün Üretim Alanlarındaki Bazı Tütün Virüslerinin Multipleks RT-PCR Yöntemi İle Araştırılması ve Bazı Virüs izolatlarının Moleküler Karekterizasyonu


Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Bitki Koruma (Yl) (Tezli), Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2019

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: Abidin GÜNAY

Asıl Danışman (Eş Danışmanlı Tezler İçin): Mustafa Usta

Özet:

Adıyaman ili tütün üretim alanlarında Tütün virüslerini (TMV, TEV, PVY, CMV ve TVBMV) tespit etmek amacı ile 2018 yılında survey çalışmaları yapılmıştır. Tütün virüslerinin varlığını test etmek için multipleks RT-PCR yöntemi kullanılmıştır. Adıyaman ilinde tespit edilen virüslerin kılıf protein genlerinin moleküler karakterizasyonları yapılmıştır. İldeki tütün tarlalarından 450 tane taze tütün yaprak örneği toplanmıştır. Test edilen 450 tütün örneğinden 40 tanesinde CMV (% 8.8), 25 tanesinde TMV (% 5.5), 1 tanesinde TMV+CMV karışık enfeksiyon (% 0.2) tespit edilmiştir. Adıyaman ilinde tütün virüslerinin genel infeksiyon oranı % 14.4 olarak bulunmuştur. Yapılan testler sonucunda toplanan tütün örneklerinde TEV, PVY, TVMBV virüsleri tespit edilememiştir. Adıyaman ilinde belirlenen virüslerin kılıf protein genlerinin tamamının moleküler klonlama karakterizasyonları yapılmıştır. Tespit edilen her virüs türünden rastgele ikişer izolat seçilerek kılıf protein genleri karakterize edilmiştir. TMV 20 nolu örnek (Gen bankası Ulaşım No:MK677444), TMV 307 nolu örnek (Gen bankası Ulaşım No:MK689859), CMV 61 nolu örnek (Gen bankası Ulaşım No:MK704430) ve CMV 73 nolu örnek (Gen bankası Ulaşım No:MK704429) virüslerinin kılıf protein genlerinin tamamı klonlanarak üniversal primerler ile DNA dizilemeleri gerçekleştirilmiştir. TMV Adıyaman izolatlarının dünyadaki 19 farklı izolatın nükleik asitleri ile % 72.3-% 99.17 değişen oranlarda benzerlik gösterdiği belirlenmiştir. CMV Adıyaman izolatlarının nükleik asit düzeyinde dünyadaki 20 farklı izolat ile % 74.09-99.54 arasında benzerlik gösterdikleri belirlenmiştir. Bu çalışma ile Adıyaman ili tütün üretim alanlarında CMV ve TMV ilk defa rapor edilmiştir.