Akademik Veri Yönetim Sistemi
Demirel S., Gürcan K., Akbulut M.(Yürütücü)
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje, BAP Y.Lisans, 2013 - 2015
Bu projenin amacı sert çekirdekli meyve grubunda çok önemli zararlar oluşturan, şarka hastalığı etmeni olan ülkemizde bulunan Plum Pox Virüs (PPV) ırklarına ait enfektif komplementer ( cDNA) vektörleri geliştirmek ve bir sonraki aşamalar için özellikle de hastalığı önlemek için vektörün kullanılabilir materyal olmasını sağlamaktır. Geliştirilen cDNA vektörleri Şarka virüs-M (Marcus) ve Şarka virüs-D (Dideron) ırkları ve de şimdiye kadar sadece Türkiye’de bulunan Şarka virüs-T (Türkiye) ırkına ait enfektif cDNA vektörleri olacaktır. Enfektif vektör oluşturma ana hatlarıyla şu aşamaları içermektedir;
• Her bir Şarka virüs ırkından total RNA elde edilecek ve elde edilen RNA dan cDNA oluşturulacaktır.
• cDNA lar uygun primerlerle çoğaltılarak cDNA fargmanları elde edilecek yada fragmanlar yine uygun primerlerle örtüşen PCR ile oluşturulacaktır.
• Elde edilen her bir fragman ayrı ayrı pGEM-T Easy vektöre klonlanacak.
• Uygun restiksiyon kesim enzimleri ile vektörlerden parçalar elde edilerek tek bir pGEM-T Easy vektöründe toplanarak klon tüm virüs genomu kapsayacaktır.
• Son olarak her bir Şarka virüs ırkına ait enfektif klonlar Nicotinia benthamiana bitkisine mekaniksel inokulasyon yolu ile bulaştırılacak ve klonların enfektif olma
durumu değerlendirilecektir.
Proje sonunda özellikle Avrupa ve Akdeniz ülkelerinde çok etkili olan, ve yalnız kayısının değil tüm Prunus türlerinin ekonomik açıdan en önemli hastalığı olan şarka virüsünün ırklarının enfektif cDNA vektörü elde edilmiş olacak, hastalığın oluşum süreci, yayılması, konak-virüs arasındaki interaksiyonun ve kontrol mekanizmalarının arasındaki ilişiki ortaya konmaya çalışılacaktır.