Bakteriyel Soğuk Su Hastalığı Etkeni Flavobacterium psychrophilum Bakteriyofajının İzolasyonu ve Karakterizasyonu


Üstündağ M., Ünaldı Çoral M.(Yürütücü)

Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje, 2020 - 2024

  • Proje Türü: Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje
  • Başlama Tarihi: Haziran 2020
  • Bitiş Tarihi: Haziran 2024

Proje Özeti

Bu çalışmada, dünyada ve ülkemizde alabalık kuluçkahanelerinde görülen ve ekonomik kayıplara sebebiyet veren, bakteriyel soğuk su hastalığı patojeni Flavobacterium psychrophilum bakterisinin izolasyonu, karakterizasyonu; patojen bakterinin doğal düşmanları olan bakteriyofajların izolasyonu ve karakterizasyonu amaçlanmıştır. Çalışmada bakteri izolasyonunda bakteriyel soğuk su hastalığına maruz kalarak ölmüş olan kırmızı benekli alabalıklar (Salmo trutta macrostigma) kullanılacak ve bu balıklar Doğa Koruma ve Milli Parklar Mersin Şube Müdürlüğü’ne bağlı Çamlıyayla Bahçe Alabalık Üretim İstasyonu’ndan temin edilecektir. Çalışmada, kırmızı benekli alabalığın; karaciğer, dalak ve böbreklerinden besiyerlerine ekim yapılacak ve sarı renkli koloniler izole edilecektir. Bakteriyofaj izolasyonu; kuluçkahane giriş, kuluçkahane çıkış ve havuz suyundan alınan numunelerin 0.22 μm por çaplı filtrelerden geçirilmesi ile gerçekleştirilecektir. Çift tabaka agar yöntemi ile bakteriyofaj varlığı tespit edilecektir. Konak bakteri suşlarına ait faj izolatları, tek plak yöntemi saflaştırıacaktır. Faj plakları gözlemlenen bakterilerin karakterizasyonu, API 20E hızlı tanı kiti ve 16S rRNA dizi analizi yapılarak belirlenecektir. Saf faj izolatları, uranil asetat ile negatif boyanarak Transmisyon Elektron Mikroskop (TEM) ile görüntülenecektir. Çalışma sonunda elde edilecek verilerin hem daha sonra yapılan çalışmalara ışık tutması hem de bakteriyofaj terapisinin potansiyelinin değerlendirilmesi için zemin oluşturması hedeflenmektedir. Ayrıca, bu çalışma ülkemiz iç sularında hızla popülasyonu azalan veya tükenmiş olan kırmız benekli alabalığın tekrar ülkemiz sularında çoğaltılmasına katkı sağlayacak nitelikte bir çalışma olacağı düşünülmektedir.