Akademik Veri Yönetim Sistemi
Uluslararası Katılımlı Türkiye VI. Bitki Koruma Kongresi, Konya, Türkiye, 5 - 08 Eylül 2016, ss.774
Van ili süs bitkisi bahçelerinde yetiĢtirilen kadife çiçeği (Tagetes erecta L.) bitkilerinde aĢırı sürgün
dallanması, cüceleĢme ve morarma belirtileri gözlemlenmiĢtir. Ġkisi mor yaprak belirtisi gösteren
toplam 5 kadife bitkisi 2014 yılı Eylül ayında örneklenmiĢtir. Simptomatik ve simptomatik olmayan
bitkilerden izole edilen genomik DNA‟lardaki 16S rDNA fragmentleri Nested Polymerase Chain
Reaction (Nested-PCR) yöntemi ile çoğaltılmıĢtır. PCR ile testlenen 5 kadife çiçeğinden belirti
gösteren ikisinde yaklaĢık 1.2-kb büyüklüğünde DNA fragmentleri elde edilmiĢtir. Çoğaltılan
fragmentler uygun bir plasmit vektörde klonlanmıĢ ve Escherichia coli‟nin JM 109 suĢuna transforme
edilmiĢtir. Rekombinant plasmit DNA‟lar izole edildikten sonra çift yönlü olarak dizilenmiĢtir.
Çoğaltılan fragmentlere ait DNA dizilerinin 1244 bp ve 1245 bp uzunluğunda oldukları tespit edilmiĢ
ve sırası ile Ġzolat 1 ve Ġzolat 2 olarak isimlendirilmiĢtir. Yürütülen BLAST analizi ve 16S rDNA
sekansının Web destekli RFLP (virtual restriction fragment length polymorphism) analizleri test edilen
numunelerde “Candidatus Phytoplasma solani” infeksiyonunu ortaya koymuĢtur. Ġzolat 1‟in 16S
rDNA dizisinin in silico analizi (benzerlik katsayısı 1.00) etmenin 16Sr XII grup ve A alt grubunda
yer aldığını göstermiĢtir (Gen Bankası ulaĢım no: AF248959). Ġzolat 2 için yürütülen benzer analizler
ise bu izolatın daha önce tespit edilmiĢ 16Sr grup ve altgruplarından farklı moleküler özellikler
sergilediğini göstermiĢtir (Gen Bankası ulaĢım no: AF248959). Bu çalıĢma ile ilk defa, T. erecta‟nın
“Ca. P. solani” tarafından infekte edildiği ve kadife çiçeğinin bu etmenin alternatif bir konukçusu
olduğu gösterilmiĢtir.