BİTKİ BÜYÜMESİNİ TEŞVİK EDİCİ MARKÖRLER BARINDIRAN BAKTERİYEL İZOLATLARIN BAZI ABİYOTİK STRES KOŞULLARINA DAYANIKLILIĞININ IN VITRO KOŞULLARDA İNCELENMESİ


Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi, Ziraat Fakültesi, Tarımsal Biyoteknoloji Bölümü, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2024

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: Şevin DEMİR

Danışman: Bilgin Taşkın

Özet:

Bitki büyümesini teşvik eden rizobakteriler (PGPR), bitki büyümesinin arttırılması ve bitki hastalıklarının yönetimi için biyokontrol ajanları olarak kullanılan mikroorganizma grubu olarak tanımlanmıştır. Endofitler ise, bitkilerin doku aralarında/içlerinde yaşayan ancak konukçusunda gözle görülen bir hastalık belirtisine neden olmayan bakteriyel veya fungal mikroorganizmaları kapsar. Bu çalışmada daha önceki laboratuvarımızda yürütülen farklı çalışmalarda fosfat çözünürlüğü, indol asetik asit üretimi, siderofor üretimi, azot fiksasyonu gibi PGPR (bitki gelişimini destekleyici) markörler açısından kayda değer sonuçlar veren 5 adet izolat belirlenerek bu izolatların sıcaklık, pH, tuz, kuraklık ve bazı ağır metallere karşı toleransları in vitro koşullarda incelenmiştir. Çalışmada, G96Y1, G105K2, G106K1-SV, V14G3 ve V27K3 kod numaralı endofit bakteri izolatlarının 25oC, 30oC, 35oC, 40oC ve 45oC sıcaklıklarındaki büyüme profilleri incelendiğinde V14G3 izolatı 45oC sıcaklıkta dahi optimum büyüme göstererek en başarılı izolat olmuştur. V27K3 izolatı kontrol tüpüne göre %5 (w/v) tuz konsantrasyonuna kadar (%5 dahil) olmak üzere optimum derecede büyüme gösterdiği ortaya konmuştur. In vivo kuraklık denemelerinde V14G3, G105K2 ve G106Y1 izolatlarının kuraklık stresine karşı en başarılı izolatlar olduğu görülmüştür. Her üç izolatın kontrol tüpüne göre %25 (w/v) PEG konsantrasyonuna kadar (%25 dahil) olmak üzere kayda değer derecede büyüme gösterdiği ortaya konmuştur. Ağır metal stres denemelerinde, G96Y1 ve V14G3 izolatları 0.05 mM Cıva (Hg) içeren NB sıvı besi ortamında büyüme göstererek Cıvaya karşı en dayanıklı izolatlar olarak değerlendirilmişlerdir. İzolatların Lityum (Li) metalinin farklı konsantrasyonlarındaki büyüme profilleri incelendiğinde 15 mM Lityum içeren NB sıvı besi ortamlarında dahil güçlü bir büyüme ortaya koymuşlardır. Kontrol tüpü ile kıyaslama yapıldığında izolatların tümünün Kobalt (Co) metaline karşı hassas olduğu gözlemlenmiştir. Test edilen konsantrasyonlarda büyüme gösterememişlerdir. Ayrıca yapılan 16s rRNA dizilemesi sonucunda G96Y1, V14G3, V27K3, G106K1-SV izolatları sırası ile %99.80, %100, %99.58 ve %99.55 benzerlik oranları ile Acinetobacter calcoaceticus, Bacillus halotolerans, Bacillus zhangzhouensis ve Pseudomonas kilonensis suşları ile eşleşmişlerdir.