Akademik Veri Yönetim Sistemi
Tezin Türü: Doktora
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Mikrobiyoloji (Veteriner) (Dr), Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2020
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: CİHAT ÖZTÜRK
Danışman: İsmail Hakkı Ekin
Özet:
Amaç: Bu
çalışmada sığır ve koyunların solunum yollarından izole edilen Mannheimia
(M.) haemolytica izolatlarının biyotipleri ve bazı önemli virülens ile
ilişkili genlerin dağılımının tespit edilmesi amaçlandı.
Yöntem:
Araştırmada 157 sığır ve 182 koyunun nazo-farengiyal ve trake-bronşiyal
bölgelerinden alınan toplam 650 svap örneğinin konvansiyonel bakteriyolojik
yöntemlerle ön identifikasyonu yapıldı. Ön identifikasyonda şüpheli olarak
tespit edilen izolatlar M. haemolytica spresifik primerlerin
kullanıldığı Real-Time PCR yöntemi ile M. haemolytica olarak identifiye
edildi. M. haemolytica izolatlarında belirlenen biyotipler BD PheonixTM otomatize
bakteri identifikasyon sistemi ile tespit edildi. Çalışmada, elde edilen
suşların virülens ile ilişkili olan O-sialoglikoproteaz (gcp), dış
membran lipoproteini (gs60), transferrin bağlayan protein (tbpB),
lökotoksin (lktC), UDP-N-asetil-D-glikozamin-2-epimeraz (nmaA) ve
adhezyon (adh) genlerinin varlığı Real Time PCR ile belirlendi.
Bulgular:
Ön
identifikasyonda Mannheimia spp. şüpheli bulunan 55 izolatın 48’i
Real-Time PCR ile M. haemolytica olarak identifiye edildi.
M.
haemlytica suşlarında arginin ve sorbitol testlerindeki
farklılık ve hayvanların sağlık durumları ile ilişkili 4 farklı biyotip tespit
edildi. Araştırmada, dört ve daha fazla virülens ile ilişkili gen tespit edilen
izolatlar virülens gen profili olarak değerlendirilirken az sayıda izolatta
virülens gen profili belirlenemedi.
Sonuç: Yapılan
bu çalışmada, arginin negatiflik ile gcp, gs60, tbpB, lktC,
adh pozitif, nmaA negatif izolatların kommensal ve patojen M.
haemolytica izolatlarının ayrımında kullanılabilecek epidemiyolojik kriter
olabileceği ve konu ile ilgili yeni çalışmaların yapılması gerektiği sonucuna
varıldı.
Anahtar
kelimeler: Mannheimia haemolytica, virülens ile ilişkili gen,
biyotip, Real Time PCR