14. Internaitonal Zeugma Conference on Scientific Research, Gaziantep, Türkiye, 9 - 10 Eylül 2025, ss.1264-1269, (Tam Metin Bildiri)
Coriandrum
sativum (kişniş), besinsel değeri yüksek ve tıbbi
açıdan önemli bileşikler içeren aromatik bir bitkidir. Bitkinin çeşitli
çevresel ve biyolojik koşullara verdiği moleküler yanıtların anlaşılması hem
metabolik yolların aydınlatılması hem de ıslah çalışmaları açısından önem
taşımaktadır. Bu çalışmada, kişnişin farklı biyolojik durumlar altındaki gen
ekspresyon değişimlerini ortaya koymak amacıyla halka açık RNA-Seq verileri
kullanılmıştır.
İlk olarak,
diziler kalite kontrol ve kırpma işlemlerine tabi tutulmuş, ardından transkript
bolluğu Salmon aracı kullanılarak hesaplanmıştır. Diferansiyel gen ekspresyon
analizleri edgeR istatistiksel paket programı ile gerçekleştirilmiştir.
Biyolojik tekrarların sınırlı olmasına rağmen, dikkatli normalizasyon ve
istatistiksel modelleme yaklaşımları sonucunda anlamlı farklılık gösteren aday
genler başarılı şekilde tanımlanmıştır.
İfade düzeyi
değişen genler daha sonra fonksiyonel açıdan incelenmiş ve biyolojik süreçlere,
moleküler fonksiyonlara ve hücresel bileşenlere ilişkin anlamlı Gene Ontology
(GO) terimleri ile bağlantılandırılmıştır. Ayrıca, Kyoto Encyclopedia of Genes
and Genomes (KEGG) yolak analizi, sekonder metabolizma ve stres yanıtı ile
ilişkili çeşitli biyokimyasal yolların bu genler aracılığıyla
düzenlenebileceğini ortaya koymuştur.
Bu çalışma, C. sativum’un moleküler düzeyde
çevresel uyum mekanizmalarını anlamaya yönelik önemli bir ilk adım olarak
değerlendirilebilir. Elde edilen bulgular, gelecekte yapılacak fonksiyonel
genomik ve biyoteknolojik uygulamalara ışık tutabilecek niteliktedir.