Akademik Veri Yönetim Sistemi
XV. ULUSAL VETERİNER MİKROBİYOLOJİ KONGRESİ ULUSLARARASI KATILIMLI, Şanlıurfa, Türkiye, 26 - 28 Ekim 2022, ss.148
Yapılan bu çalışmada, koyunlardan elde edilen Mannheimia (M.) haemolytica izolatlarında Real-Time PCR yöntemiyle serotip A1, A2 ve A6 ile RAPD ve BOX PCR yöntemleri kullanılarak M. haemolytica izolatlarının genotiplerinin belirlenmesi amaçlandı. Araştırmada, Van YYÜ Veteriner Fakültesi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı kültür koleksiyonunda bulunan ve koyunlardan izole edilen 44 M. haemolytica izolatı kullanıldı. Real-Time PCR yöntemiyle 44 M. haemolytica izolatının 27 (%61.4)’si serotiplendirilirken, 17 (%38.6) izolat serotiplendirilemedi. Buna göre, 27 izolatın 6 (%22.2)’sı serotip A1, 12 (%44.4)’si serotip A2, 9 (%33.4)’u da serotip A6 olarak tespit edildi. RAPD PCR ile yapılan genotiplendirmede, OPA 4 primeri ile 18 farklı genotip, OPA 9 primeriyle de 3 farklı genotip belirlenirken, BOX PCR yöntemiyle yapılan genotiplendirmede, 15 faklı genotip oluştuğu tespit edildi. Çalışmada, M. haemolytica serotipleri (A1, A2, A6) ile genotipler arasında istatistiksel olarak anlamlı bir ilişki olmadığı, M. haemolytica serotip A1, A2 ve A6 izolatlarının teşhisi için bu araştırmada uygulanan Real-Time PCR yönteminin uygun olduğu belirlendi. M. haemolytica izolatları arasında genetik çeşitliliği tespit etmek için RAPD PCR’da OPA 9 primerinin genotiplendirme için uygun olmadığı, OPA 4 primeri ve BOX PCR BOXA1R primerinin genotiplendirme için epidemiyolojik çalışmalarda kullanılabileceği ve BOXA1R primeri ile daha uygun bant profili elde edildiği tespit edildi.
In this study, it was aimed to determine serotypes A1, A2 and A6 in M. haemolytica isolates obtained from sheep by Real-Time PCR method, as well as to determine the genotypes of M. haemolytica isolates using two distinct RAPD PCR and BOX PCR methods. In the study, 44 M. haemolytica strains, isolated from sheep in the culture collection of Van YYU Faculty of Veterinary Medicine Microbiology Department were used. While 27 (61.4%) of 44 M. haemolytica isolates could be serotyped by Real-Time PCR method, 17 isolates could not serotyped. Accordingly, 6 (22.2%), 12 (44.4%) and 9 (33.4%) of the 27 isolates were identified as serotype A1, A2 and A6, respectively. In RAPD PCR, 18 different genotypes were determined with OPA 4 primer, while 3 different genotypes were determined with OPA 9 primer. In BOX PCR, 15 different genotypes were obtained. In this study, it was determined that there was no statistically significant relationship between M. haemolytica serotypes (A1, A2, A6) and genotypes, and the Real-Time PCR method used in this study was appropriate for the detection of M. haemolytica serotypes A1, A2 and A6 isolates. It was determined that OPA 9 primer was not suitable for genotyping to detect genetic diversity among M. haemolytica isolates, OPA 4 primer and BOX PCR could be used in epidemiological studies for genotyping and BOXA1R in BOX PCR produced more appropriate bands. It has been concluded that in the prevention-control programs to be carried out for pneumonia cases caused by M. haemolytica, vaccine development studies should be carried out by determining the serotypes and genotypes that are common at the regional-national level; and new studies should be carried out in different regions by determining the serotype and genotypes of M. haemolytica.